6.8. Tools to Speed Up Code¶
This section covers some tools to speed up your code.
6.8.1. Fastai’s df_shrink: Shrink DataFrame’s Memory Usage in One Line of Code¶
!pip install fastai
Changing data types of DataFrame columns to smaller data types can significantly reduce the memory usage of the DataFrame. Instead of manually choosing smaller data types, is there a way that you can automatically change data types in one line of code?
That is when the df_shrink method of Fastai comes in handy. In the code below, the memory usage of the DataFrame decreases from 200 bytes to 146 bytes.
from fastai.tabular.core import df_shrink
import pandas as pd
df = pd.DataFrame({"col1": [1, 2, 3], "col2": [1.0, 2.0, 3.0]})
print(df.info())
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 3 entries, 0 to 2
Data columns (total 2 columns):
# Column Non-Null Count Dtype
--- ------ -------------- -----
0 col1 3 non-null int64
1 col2 3 non-null float64
dtypes: float64(1), int64(1)
memory usage: 176.0 bytes
None
new_df = df_shrink(df)
print(new_df.info())
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 3 entries, 0 to 2
Data columns (total 2 columns):
# Column Non-Null Count Dtype
--- ------ -------------- -----
0 col1 3 non-null int8
1 col2 3 non-null float32
dtypes: float32(1), int8(1)
memory usage: 143.0 bytes
None
6.8.2. Swifter: Add One Word to Make Your Pandas Apply 23 Times Faster¶
!pip install swifter
If you want to have faster pandas apply when working with large data, try swifter. To use swifter, simply add .swifter before .apply. Everything else is the same.
In the code below, I compared the speed of Pandas’ apply and the speed of swifter’s apply using the California housing dataset of 20640 rows.
from time import time
from sklearn.datasets import fetch_california_housing
from scipy.special import boxcox1p
import swifter
import timeit
X, y = fetch_california_housing(return_X_y=True, as_frame=True)
def pandas_apply():
X["AveRooms"].apply(lambda x: boxcox1p(x, 0.25))
def swifter_apply():
X["AveRooms"].swifter.apply(lambda x: boxcox1p(x, 0.25))
num_experiments = 100
pandas_time = timeit.timeit(pandas_apply, number=num_experiments)
swifter_time = timeit.timeit(swifter_apply, number=num_experiments)
pandas_vs_swifter = round(pandas_time / swifter_time, 2)
print(f"Swifter apply is {pandas_vs_swifter} times faster than Pandas apply")
Swifter apply is 16.82 times faster than Pandas apply
Using swifter apply is 23.56 times faster than Pandas apply! This ratio is calculated by taking the average run time of each method after 100 experiments.
6.8.3. pyinstrument: Readable Python Profiler¶
!pip install pyinstrument
Have you ever wanted to get statistics of how long various parts of your code are executed to optimize your code? profile and CProfile allow you to profile your code, but the outputs are long and hard to understand, especially when using high-level libraries like pandas.
For example, applying cProfile to the code using pandas will me the output like below:
# cprofilers_example.py
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.DataFrame({'nums': np.random.randint(0, 100, 10000)})
def is_even(num: int) -> int:
return num % 2 == 0
df = df.assign(is_even=lambda df_: is_even(df_.nums))
On your terminal:
$ python -m cProfile cprofilers_example.py
!python -m cProfile cprofilers_example.py
246355 function calls (240252 primitive calls) in 0.311 seconds
Ordered by: standard name
ncalls tottime percall cumtime percall filename:lineno(function)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(<module>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(append)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(bincount)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(concatenate)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(copyto)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(ndim)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(prod)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(ravel)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:1002(_gcd_import)
610/353 0.001 0.000 0.144 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:1017(_handle_fromlist)
1208 0.002 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:103(release)
527 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:143(__init__)
527 0.000 0.000 0.004 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:147(__enter__)
527 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:151(__exit__)
1208 0.002 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:157(_get_module_lock)
524 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:176(cb)
681 0.001 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:194(_lock_unlock_module)
681/1 0.000 0.000 0.310 0.310 <frozen importlib._bootstrap>:211(_call_with_frames_removed)
4196 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:222(_verbose_message)
23 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:232(_requires_builtin_wrapper)
521 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:342(__init__)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:35(_new_module)
880 0.001 0.000 0.005 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:376(cached)
727 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:389(parent)
498 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:397(has_location)
24 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:406(spec_from_loader)
498 0.002 0.000 0.009 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:477(_init_module_attrs)
498/495 0.001 0.000 0.032 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:549(module_from_spec)
524 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:58(__init__)
498/1 0.002 0.000 0.310 0.310 <frozen importlib._bootstrap>:650(_load_unlocked)
520 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:725(find_spec)
23 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:746(create_module)
23 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:754(exec_module)
23 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:771(is_package)
1208 0.002 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:78(acquire)
497 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:800(find_spec)
1530 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:863(__enter__)
1530 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:867(__exit__)
520 0.003 0.000 0.032 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:890(_find_spec)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:937(_sanity_check)
527/1 0.002 0.000 0.311 0.311 <frozen importlib._bootstrap>:956(_find_and_load_unlocked)
527/1 0.002 0.000 0.311 0.311 <frozen importlib._bootstrap>:986(_find_and_load)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1004(__init__)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1029(get_filename)
406 0.002 0.000 0.011 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1034(get_data)
406 0.000 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1075(path_stats)
68 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1153(__init__)
68 0.000 0.000 0.021 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1164(create_module)
68/39 0.000 0.000 0.058 0.001 <frozen importlib._bootstrap_external>:1172(exec_module)
3858 0.002 0.000 0.006 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:121(_path_join)
3858 0.002 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:123(<listcomp>)
812 0.001 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:127(_path_split)
1624 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:129(<genexpr>)
53 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1317(_path_hooks)
820 0.000 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1330(_path_importer_cache)
1896 0.001 0.000 0.007 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:135(_path_stat)
497 0.002 0.000 0.026 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1367(_get_spec)
497 0.000 0.000 0.026 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1399(find_spec)
704 0.001 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:145(_path_is_mode_type)
53 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1459(__init__)
424 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1465(<genexpr>)
474 0.001 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1493(_get_spec)
733 0.006 0.000 0.022 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1498(find_spec)
651 0.000 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:154(_path_isfile)
53 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1549(_fill_cache)
53 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:159(_path_isdir)
53 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1590(path_hook_for_FileFinder)
527 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:175(_path_isabs)
812 0.003 0.000 0.007 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:354(cache_from_source)
474 0.001 0.000 0.005 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:484(_get_cached)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:516(_check_name_wrapper)
406 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:553(_classify_pyc)
406 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:586(_validate_timestamp_pyc)
406 0.001 0.000 0.038 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:638(_compile_bytecode)
733 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:68(_relax_case)
474 0.001 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:689(spec_from_file_location)
1218 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:79(_unpack_uint32)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:839(create_module)
406/1 0.001 0.000 0.310 0.310 <frozen importlib._bootstrap_external>:842(exec_module)
406 0.003 0.000 0.059 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:914(get_code)
53 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen zipimport>:63(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <string>:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <string>:1(__create_fn__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <string>:1(__new__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __config__.py:3(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __future__.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __future__.py:81(_Feature)
10 0.000 0.000 0.000 0.000 __future__.py:83(__init__)
48 0.001 0.000 0.506 0.011 __init__.py:1(<module>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:101(CFunctionType)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1042(StreamHandler)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:107(import_lzma)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:109(import_module)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:11(DeprecatedTzFormatWarning)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1125(FileHandler)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1194(_StderrHandler)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1200(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1218(PlaceHolder)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1260(Manager)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1265(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:127(EmptyDataError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1280(disable)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:129(InvalidVersion)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:134(ParserWarning)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:135(_BaseVersion)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1389(Logger)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1404(__init__)
14 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:141(_check_size)
8 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:144(__lt__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:15(IntCastingNaNError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:151(align_method_SERIES)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:153(py_object)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:162(c_short)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:164(set_testing_mode)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:166(c_ushort)
1 0.000 0.000 0.002 0.002 __init__.py:17(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:170(c_long)
22 0.000 0.000 0.001 0.000 __init__.py:171(flex_method_SERIES)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:174(c_ulong)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1743(RootLogger)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1749(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:175(MergeError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:1760(LoggerAdapter)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:181(LegacyVersion)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:182(AccessorRegistrationWarning)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:183(c_int)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:187(c_uint)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:188(AbstractMethodError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:191(c_float)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:193(_checkLevel)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:195(c_double)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:199(c_longdouble)
5 0.000 0.000 0.037 0.007 __init__.py:2(<module>)
1 0.000 0.000 0.019 0.019 __init__.py:20(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:21(__deprecated_private_func)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:211(NumbaUtilError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:213(UTC)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:2147(NullHandler)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:217(DuplicateLabelError)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:218(_acquireLock)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:220(c_ubyte)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:227(_releaseLock)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:227(c_byte)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:231(_sanity_check)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:232(c_char)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:237(c_char_p)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:238(InvalidIndexError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:24(NullFrequencyError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:243(c_void_p)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:248(_register_at_fork_reinit_lock)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:248(c_bool)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:253(c_wchar_p)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:258(c_wchar)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:26(InfinityType)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:261(_reset_cache)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:276(LogRecord)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:299(loads)
3 0.000 0.000 0.311 0.104 __init__.py:3(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:313(_CountryTimezoneDict)
32 0.001 0.000 0.004 0.000 __init__.py:313(namedtuple)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:318(CDLL)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:323(<genexpr>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:339(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:34(PerformanceWarning)
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3 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:36(__deprecate_private_class)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:424(__init__)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:48(UnsortedIndexError)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:498(PYFUNCTYPE)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 __init__.py:499(CFunctionType)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 _core.py:620(PlotAccessor)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 _factories.py:13(__call__)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 _factories.py:9(__init__)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 _globals.py:30(ModuleDeprecationWarning)
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4 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:484(<genexpr>)
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3 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:6398(_maybe_cast_data_without_dtype)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:6445(unpack_nested_dtype)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:725(is_)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:800(__array__)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:82(PandasObject)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:848(view)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 base.py:90(ExtensionArray)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 base64.py:3(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 base_parser.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 base_parser.py:117(ParserBase)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 base_parser.py:118(BadLineHandleMethod)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 bisect.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 blocks.py:1(<module>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 blocks.py:2021(ensure_block_shape)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 blocks.py:238(mgr_locs)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 blocks.py:261(make_block_same_class)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 blocks.py:340(shape)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 blocks.py:344(dtype)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 blocks.py:349(iget)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 blocks.py:646(copy)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 boolean.py:238(BooleanArray)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 bz2.py:30(BZ2File)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 c_parser_wrapper.py:29(CParserWrapper)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:148(Calendar)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:410(HTMLCalendar)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:52(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:53(<lambda>)
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2 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:55(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:558(LocaleTextCalendar)
26 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:58(__getitem__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:589(LocaleHTMLCalendar)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:69(_localized_day)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:72(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:74(__init__)
14 0.000 0.000 0.000 0.000 calendar.py:77(__getitem__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 cast.py:1(<module>)
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3 0.000 0.000 0.000 0.000 cast.py:1969(construct_1d_object_array_from_listlike)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 cast.py:2156(can_hold_element)
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6 0.000 0.000 0.000 0.000 categorical.py:123(_cat_compare_op)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 categorical.py:247(Categorical)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 categorical.py:2472(CategoricalAccessor)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 category.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 category.py:56(CategoricalIndex)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 chainmap.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 chainmap.py:12(DeepChainMap)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 chebyshev.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 chebyshev.py:1982(Chebyshev)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 check.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 clipboards.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.003 0.003 cloudpickle.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 cloudpickle.py:706(instance)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 cloudpickle.py:722(_empty_cell_value)
1 0.000 0.000 0.002 0.002 cloudpickle_fast.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 cloudpickle_fast.py:513(CloudPickler)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 codecs.py:260(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 codecs.py:309(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 codecs.py:319(decode)
6 0.000 0.000 0.004 0.001 common.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 common.py:1035(is_numeric_v_string_like)
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6 0.000 0.000 0.000 0.000 common.py:1230(is_float_dtype)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 common.py:61(SettingWithCopyWarning)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 common.py:758(_BytesZipFile)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 common.py:76(IOHandles)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 common.py:779(is_unsigned_integer_dtype)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 common.py:815(_MMapWrapper)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 compat.py:1(<module>)
1239 0.000 0.000 0.006 0.000 compute.py:134(<genexpr>)
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189 0.000 0.000 0.000 0.000 compute.py:171(_make_generic_wrapper)
1 0.000 0.000 0.037 0.037 compute.py:18(<module>)
189 0.001 0.000 0.006 0.000 compute.py:183(_make_signature)
189 0.001 0.000 0.016 0.000 compute.py:203(_wrap_function)
1 0.000 0.000 0.016 0.016 compute.py:218(_make_global_functions)
378 0.000 0.000 0.001 0.000 compute.py:74(_get_arg_names)
189 0.001 0.000 0.008 0.000 compute.py:78(_decorate_compute_function)
3 0.000 0.000 0.007 0.002 concat.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 concat.py:310(_Concatenator)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 concat.py:327(JoinUnit)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:1(<module>)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:114(_get_option)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:191(DictWrapper)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:194(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:237(CallableDynamicDoc)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:238(__init__)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:242(__call__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:392(option_context)
62 0.000 0.000 0.001 0.000 config.py:424(register_option)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:499(deprecate_option)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:547(_select_options)
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5 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:606(_translate_key)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:618(_warn_if_deprecated)
48 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:707(config_prefix)
72 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:737(wrap)
62 0.000 0.000 0.001 0.000 config.py:738(inner)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:760(is_type_factory)
22 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:774(inner)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:781(is_instance_factory)
7 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:800(inner)
16 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:807(is_one_of_factory)
16 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:809(<listcomp>)
16 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:810(<listcomp>)
16 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:812(inner)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:826(is_nonnegative_int)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:85(OptionError)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 config.py:96(_get_single_key)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 config_init.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config_init.py:324(is_terminal)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 config_init.py:696(register_plotting_backend_cb)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 console.py:1(<module>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:100(arrays_to_mgr)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:215(mgr_to_mgr)
12 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:369(extract_array)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:396(dict_to_mgr)
12 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:431(ensure_wrapped_if_datetimelike)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:445(<listcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:448(<listcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:449(<listcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:456(<listcomp>)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:463(sanitize_array)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:560(_homogenize)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:598(_extract_index)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:606(_sanitize_ndim)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:643(_sanitize_str_dtypes)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:663(_maybe_repeat)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:674(_try_cast)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 construction.py:781(is_empty_data)
24 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:108(__enter__)
24 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:117(__exit__)
19 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:211(contextmanager)
24 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:238(helper)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:379(_create_cb_wrapper)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:381(_exit_wrapper)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:385(__init__)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:429(callback)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:463(_push_exit_callback)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:479(__enter__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:482(__exit__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:59(_recreate_cm)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:71(__call__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:72(inner)
24 0.000 0.000 0.000 0.000 contextlib.py:82(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contexts.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 contexts.py:212(RNGContext)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 copy.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 copy.py:55(Error)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 copy.py:66(copy)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 copyreg.py:12(pickle)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 copyreg.py:22(constructor)
1 0.000 0.000 0.003 0.003 core.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:1126(_DomainedBinaryOperation)
6 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:1147(__init__)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:115(doc_note)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:1284(_replace_dtype_fields_recursive)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:1316(_replace_dtype_fields)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:1330(make_mask_descr)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:1363(getmask)
44 0.000 0.000 0.001 0.000 core.py:138(get_object_signature)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:155(MAError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:163(MaskError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:197(<listcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:198(<listcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:201(<listcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:202(<listcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2383(_MaskedPrintOption)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2389(__init__)
7 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2555(_arraymethod)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2600(MaskedIterator)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2708(MaskedArray)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2819(__new__)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2949(_update_from)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:2975(__array_finalize__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:3124(view)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:3406(dtype)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:3422(shape)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6234(mvoid)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6429(MaskedConstant)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6433(__has_singleton)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6439(__new__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6457(__array_finalize__)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6532(__setattr__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6624(_extrema_operation)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6633(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:6739(_frommethod)
26 0.000 0.000 0.001 0.000 core.py:6750(__init__)
26 0.000 0.000 0.001 0.000 core.py:6755(getdoc)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:798(_DomainCheckInterval)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:807(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:8081(_convert2ma)
8 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:8094(__init__)
8 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:8099(getdoc)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:823(_DomainTan)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:831(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:84(MaskedArrayFutureWarning)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:841(_DomainSafeDivide)
6 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:847(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:862(_DomainGreater)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:868(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:878(_DomainGreaterEqual)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:884(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:894(_MaskedUFunc)
52 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:895(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:904(_MaskedUnaryOperation)
26 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:922(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:978(_MaskedBinaryOperation)
18 0.000 0.000 0.000 0.000 core.py:998(__init__)
1 0.000 0.000 0.312 0.312 cprofilers_example.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 cprofilers_example.py:5(is_even)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 cprofilers_example.py:8(<lambda>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 css.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 css.py:10(CSSWarning)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 css.py:16(_side_expander)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 css.py:30(CSSResolver)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:130(DictWriter)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:165(Sniffer)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:2(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:23(Dialect)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:54(excel)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:64(excel_tab)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:69(unix_dialect)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 csv.py:80(DictReader)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 ctypeslib.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 ctypeslib.py:177(_ndptr)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 ctypeslib.py:198(_concrete_ndptr)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 ctypeslib.py:357(_get_scalar_type_map)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 ctypeslib.py:368(<dictcomp>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:1(<module>)
2 0.000 0.000 0.001 0.000 dataclasses.py:1010(wrap)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:155(FrozenInstanceError)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:160(_HAS_DEFAULT_FACTORY_CLASS)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:167(_MISSING_TYPE)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:176(_FIELD_BASE)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:177(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:202(_InitVarMeta)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:206(InitVar)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:231(Field)
10 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:244(__init__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:281(__set_name__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:289(_DataclassParams)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:298(__init__)
10 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:320(field)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:342(_tuple_str)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:351(<listcomp>)
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6 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:375(_create_fn)
24 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:389(<genexpr>)
10 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:402(_field_assign)
10 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:414(_field_init)
10 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:468(_init_param)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:487(_init_fn)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:505(<dictcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:530(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:537(_repr_fn)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:541(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:573(_cmp_fn)
20 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:595(_is_classvar)
20 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:603(_is_initvar)
20 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:610(_is_type)
10 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:669(_get_field)
6 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:751(_set_new_attribute)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:765(_hash_set_none)
2 0.000 0.000 0.001 0.000 dataclasses.py:807(_process_class)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:861(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:922(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:938(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:941(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 dataclasses.py:947(<listcomp>)
2 0.000 0.000 0.001 0.000 dataclasses.py:996(dataclass)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 date_converters.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 dates.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 datetime.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:1141(tzinfo)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:1211(time)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:1236(__new__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:1559(datetime)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:1567(__new__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:2181(timezone)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:2201(_create)
35 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:379(_check_int_field)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:41(_days_before_year)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:411(_check_date_fields)
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5 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:46(_days_in_month)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:469(timedelta)
12 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:488(__new__)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:661(__neg__)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:789(date)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 datetime.py:819(__new__)
2 0.000 0.000 0.002 0.001 datetimelike.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 datetimelike.py:135(InvalidComparison)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 hashlib.py:5(<module>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 hermite.py:1641(Hermite)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 index_tricks.py:547(__init__)
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124 0.000 0.000 0.000 0.000 inspect.py:513(_is_wrapper)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 inspect.py:895(EndOfBlock)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 invalid.py:1(<module>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 shutil.py:89(_GiveupOnFastCopy)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 signal.py:1(<module>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 six.py:219(is_package)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 six.py:493(Module_six_moves_urllib)
8 0.000 0.000 0.000 0.000 six.py:80(_add_doc)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 six.py:85(_import_module)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 six.py:880(add_metaclass)
3 0.000 0.000 0.000 0.000 six.py:882(wrapper)
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1 0.000 0.000 0.002 0.002 socket.py:4(<module>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 spss.py:1(<module>)
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178 0.000 0.000 0.000 0.000 sre_parse.py:168(__setitem__)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 sre_parse.py:978(addgroup)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 stata.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 stata.py:1043(StataReader)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 stata.py:628(StataValueLabel)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 stride_tricks.py:14(DummyArray)
1 0.000 0.000 0.001 0.001 string.py:1(<module>)
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1 0.000 0.000 0.001 0.001 string.py:67(__init__)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 string_.py:57(StringDtype)
1 0.000 0.000 0.037 0.037 string_arrow.py:1(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 string_arrow.py:92(ArrowStringArray)
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1 0.000 0.000 0.002 0.002 subprocess.py:10(<module>)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 subprocess.py:1052(poll)
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12 0.000 0.000 0.000 0.000 take.py:324(_view_wrapper)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 tempfile.py:262(_RandomNameSequence)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 textwrap.py:465(indent)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 threading.py:1095(daemon)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 threading.py:750(Thread)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 threading.py:94(_RLock)
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24 0.000 0.000 0.000 0.000 tokenize.py:94(<listcomp>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 traceback.py:440(TracebackException)
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1 0.000 0.000 0.001 0.001 type_check.py:1(<module>)
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1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'get_indexer' of 'pandas._libs.index.IndexEngine' objects}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'get_loc' of 'pandas._libs.index.IndexEngine' objects}
140 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'group' of 're.Match' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'groups' of 're.Match' objects}
5 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'index' of 'tuple' objects}
8 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'insert' of 'list' objects}
1026 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'isidentifier' of 'str' objects}
1586 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'isupper' of 'str' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'items' of 'collections.OrderedDict' objects}
239 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'items' of 'dict' objects}
64 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'items' of 'mappingproxy' objects}
5710 0.002 0.000 0.012 0.000 {method 'join' of 'str' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'keys' of 'collections.OrderedDict' objects}
11 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'keys' of 'dict' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'list_functions' of 'pyarrow._compute.FunctionRegistry' objects}
161 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'lower' of 'str' objects}
47 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'lstrip' of 'str' objects}
308 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'match' of 're.Pattern' objects}
14 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'mro' of 'type' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'nonzero' of 'numpy.ndarray' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'pop' of 'collections.OrderedDict' objects}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'pop' of 'collections.deque' objects}
535 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'pop' of 'dict' objects}
80 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'pop' of 'list' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'randint' of 'numpy.random.mtrand.RandomState' objects}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'ravel' of 'numpy.ndarray' objects}
413 0.004 0.000 0.004 0.000 {method 'read' of '_io.BufferedReader' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'read' of '_io.TextIOWrapper' objects}
3 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'reduce' of 'numpy.ufunc' objects}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'release' of '_thread.RLock' objects}
9 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'remove' of 'list' objects}
14 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'remove' of 'set' objects}
145 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'replace' of 'str' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'reshape' of 'numpy.ndarray' objects}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'reverse' of 'list' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'rfind' of 'bytes' objects}
816 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'rfind' of 'str' objects}
3036 0.001 0.000 0.001 0.000 {method 'rpartition' of 'str' objects}
8532 0.001 0.000 0.001 0.000 {method 'rstrip' of 'str' objects}
28 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'search' of 're.Pattern' objects}
49 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'setdefault' of 'dict' objects}
29 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'setter' of 'property' objects}
10 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'sort' of 'list' objects}
6 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'split' of 're.Pattern' objects}
105 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'split' of 'str' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'splitlines' of 'str' objects}
14 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'startswith' of 'bytes' objects}
20623 0.002 0.000 0.002 0.000 {method 'startswith' of 'str' objects}
38 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'strftime' of 'datetime.date' objects}
466 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'strip' of 'str' objects}
2544 0.011 0.000 0.011 0.000 {method 'sub' of 're.Pattern' objects}
5 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'tolist' of 'memoryview' objects}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'toordinal' of 'datetime.date' objects}
24 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'translate' of 'bytearray' objects}
142 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'translate' of 'str' objects}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'transpose' of 'numpy.ndarray' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'union' of 'set' objects}
621 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'update' of 'dict' objects}
3 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'update' of 'set' objects}
37 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'upper' of 'str' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'values' of 'collections.OrderedDict' objects}
21 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'values' of 'dict' objects}
125 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'values' of 'mappingproxy' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'view' of 'numpy.generic' objects}
4/3 0.000 0.000 0.000 0.000 {method 'view' of 'numpy.ndarray' objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.algos.ensure_platform_int}
2 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.infer_dtype}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.is_all_arraylike}
3 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.is_float}
3 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.is_iterator}
13 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.is_list_like}
12 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.is_scalar}
5 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.item_from_zerodim}
3 0.000 0.000 0.000 0.000 {pandas._libs.lib.maybe_convert_objects}
1 0.000 0.000 0.000 0.000 {pyarrow._compute.function_registry}
A small portion of the output:
246355 function calls (240252 primitive calls) in 0.311 seconds
Ordered by: standard name
ncalls tottime percall cumtime percall filename:lineno(function)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(<module>)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(append)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(bincount)
5 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(concatenate)
4 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(copyto)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(ndim)
1 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(prod)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <__array_function__ internals>:2(ravel)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:1002(_gcd_import)
610/353 0.001 0.000 0.144 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:1017(_handle_fromlist)
1208 0.002 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:103(release)
527 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:143(__init__)
527 0.000 0.000 0.004 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:147(__enter__)
527 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:151(__exit__)
1208 0.002 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:157(_get_module_lock)
524 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:176(cb)
681 0.001 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:194(_lock_unlock_module)
681/1 0.000 0.000 0.310 0.310 <frozen importlib._bootstrap>:211(_call_with_frames_removed)
4196 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:222(_verbose_message)
23 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:232(_requires_builtin_wrapper)
521 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:342(__init__)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:35(_new_module)
880 0.001 0.000 0.005 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:376(cached)
727 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:389(parent)
498 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:397(has_location)
24 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:406(spec_from_loader)
498 0.002 0.000 0.009 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:477(_init_module_attrs)
498/495 0.001 0.000 0.032 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:549(module_from_spec)
524 0.001 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:58(__init__)
498/1 0.002 0.000 0.310 0.310 <frozen importlib._bootstrap>:650(_load_unlocked)
520 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:725(find_spec)
23 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:746(create_module)
23 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:754(exec_module)
23 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:771(is_package)
1208 0.002 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:78(acquire)
497 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:800(find_spec)
1530 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:863(__enter__)
1530 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:867(__exit__)
520 0.003 0.000 0.032 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:890(_find_spec)
2 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap>:937(_sanity_check)
527/1 0.002 0.000 0.311 0.311 <frozen importlib._bootstrap>:956(_find_and_load_unlocked)
527/1 0.002 0.000 0.311 0.311 <frozen importlib._bootstrap>:986(_find_and_load)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1004(__init__)
406 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1029(get_filename)
406 0.002 0.000 0.011 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1034(get_data)
406 0.000 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1075(path_stats)
68 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1153(__init__)
68 0.000 0.000 0.021 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1164(create_module)
68/39 0.000 0.000 0.058 0.001 <frozen importlib._bootstrap_external>:1172(exec_module)
3858 0.002 0.000 0.006 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:121(_path_join)
3858 0.002 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:123(<listcomp>)
812 0.001 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:127(_path_split)
1624 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:129(<genexpr>)
53 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1317(_path_hooks)
820 0.000 0.000 0.002 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1330(_path_importer_cache)
1896 0.001 0.000 0.007 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:135(_path_stat)
497 0.002 0.000 0.026 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1367(_get_spec)
497 0.000 0.000 0.026 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1399(find_spec)
704 0.001 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:145(_path_is_mode_type)
53 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1459(__init__)
424 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1465(<genexpr>)
474 0.001 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1493(_get_spec)
733 0.006 0.000 0.022 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1498(find_spec)
651 0.000 0.000 0.003 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:154(_path_isfile)
53 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1549(_fill_cache)
53 0.000 0.000 0.000 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:159(_path_isdir)
53 0.000 0.000 0.001 0.000 <frozen importlib._bootstrap_external>:1590(path_hook_for_FileFinder)
You can get a more readable output using pyinstrument. To use pyinstrument, simply insert the piece of code you want to profile between profiler.start and profile.end:
# pyinstrument_example.py
from pyinstrument import Profiler
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.DataFrame({'nums': np.random.randint(0, 100, 10000)})
def is_even(num: int) -> int:
return num % 2 == 0
profiler = Profiler()
profiler.start()
df = df.assign(is_even=lambda df_: is_even(df_.nums))
profiler.stop()
profiler.print()
On your terminal, type:
$ pyinstrument pyinstrument_example.py
… and you should see an output like below:
!pyinstrument pyinstrument_example.py
_ ._ __/__ _ _ _ _ _/_ Recorded: 09:04:59 Samples: 1
/_//_/// /_\ / //_// / //_'/ // Duration: 0.001 CPU time: 0.001
/ _/ v4.0.3
Program: pyinstrument_example.py
0.001 <module> pyinstrument_example.py:1
└─ 0.001 assign pandas/core/frame.py:4416
[2 frames hidden] pandas
0.001 apply_if_callable pandas/core/common.py:346
└─ 0.001 <lambda> pyinstrument_example.py:12
└─ 0.001 is_even pyinstrument_example.py:6
└─ 0.001 new_method pandas/core/ops/common.py:54
[9 frames hidden] pandas, <built-in>
0.001 mod <built-in>:0
_ ._ __/__ _ _ _ _ _/_ Recorded: 09:04:59 Samples: 225
/_//_/// /_\ / //_// / //_'/ // Duration: 0.265 CPU time: 1.897
/ _/ v4.0.3
Program: pyinstrument_example.py
0.265 <module> <string>:1
[4 frames hidden] <string>, runpy
0.265 _run_code runpy.py:64
└─ 0.265 <module> pyinstrument_example.py:1
└─ 0.261 <module> pandas/__init__.py:3
[650 frames hidden] pandas, pyarrow, <built-in>, textwrap...
To view this report with different options, run:
pyinstrument --load-prev 2021-09-15T09-04-59 [options]